Una critica situación atraviesa la construcción de la sede Tumaco de la Universidad Nacional tras la pérdida de una donación de 12 millones de euros (equivalentes a 55.000 millones de pesos) por parte de Países Bajos, la cual habia sido cancelada debido a retrasos en la ejecución del proyecto, lo que dejó a la obra sin financiación y sumida en la incertidumbre, por lo que las demoras en el proceso llevaron a la ONG Invest International, financiada por el Reino de Países Bajos, a retirarse definitivamente en diciembre de 2023.
El ministro de Educación, Daniel Rojas, ha asegurado que el Gobierno asumirá el compromiso financiero, afirmando que los recursos serán tomados del Presupuesto General de la Nación. Sin embargo, la difícil situación fiscal del país, marcada por problemas de liquidez y un presupuesto desfinanciado, pone en duda la viabilidad de esta promesa. Desde su inicio en 2016, el proyecto ha enfrentado constantes retrasos y problemas de contratación. La sede actualmente opera en aulas modulares construidas con contenedores.